This looks like a Soaplab service. Click here for more info and guidance on how to use this service
About Soaplab
Soaplab services are command line applications, wrapped as SOAP services, and served from a Soaplab server. All Soaplab services have the same generic set of SOAP operations (depending on the Soaplab version) as they all share a standardised interface.
Certain tools, like the Taverna workflow workbench, provide automatic support for the Soaplab way of executing these services. In some cases you will need to use the Soaplab Server Base URL rather than the WSDL location in these tools.
More information on Soaplab clients is available here.
Further documentation on Soaplab services is available:
- Soaplab overview
- Soaplab client guide page
- EBI Soaplab server documentation
- Soaplab 2
- Sourceforge site for EMBOSS Soaplab services
Provider:
European Bioinformatics Institute (EBI)
Location:
UNITED KINGDOM
Submitter / Source:
Gilles (29 days ago)
Base URL:
http://www.ebi.ac.uk/soaplab/services/alignment_multiple.mse
WSDL Location:
http://www.ebi.ac.uk/soaplab/services/alignment_multiple.mse?wsdl(download last cached WSDL file)
Documentation URL(s): None Login to add a documentation URL Description(s): No description(s) yet Login to add a description Details (from Soaplab server): from Soaplab server(8 days ago)
- ds_lsr_analysis :
- analysis :
- name : mse
- output :
- type : Alignment multiple
- version : 6.3.0
- installation : Soaplab2 default installation
- description : Multiple Sequence Editor
- input :
- analysis_extension :
- analysis :
- ds_lsr_analysis :
- analysis :
- name : mse
- output :
- type : Alignment multiple
- version : 6.3.0
- installation : Soaplab2 default installation
- description : Multiple Sequence Editor
- input :
- name : gcgmode
- default : false
- mandatory : false
- type : boolean
- name : protein
- default : false
- mandatory : false
- type : boolean
- analysis_extension :
- parameter :
- data :
- list :
- list_item :
- level : 0
- value : abi
- level : 0
- value : ace
- level : 0
- value : acedb
- level : 0
- value : bam
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- level : 0
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- level : 0
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- level : 0
- value : experiment
- level : 0
- value : fasta
- level : 0
- value : fastq
- level : 0
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- value : fastq-sanger
- level : 0
- value : fastq-solexa
- level : 0
- value : fitch
- level : 0
- value : gcg
- level : 0
- value : genbank
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- value : genpept
- level : 0
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- level : 0
- value : hennig86
- level : 0
- value : ig
- level : 0
- value : igstrict
- level : 0
- value : jackknifer
- level : 0
- value : mase
- level : 0
- value : mega
- level : 0
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- level : 0
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- level : 0
- value : nexus
- level : 0
- value : pdb
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- level : 0
- value : pdbnucseq
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- value : pdbseq
- level : 0
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- level : 0
- value : phylip
- level : 0
- value : phylipnon
- level : 0
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- level : 0
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- level : 0
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- level : 0
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- value : strider
- level : 0
- value : swiss
- level : 0
- value : text
- level : 0
- value : treecon
- type : full
- list_item :
- list :
- base :
- base :
- ordering : 4
- name : gcgmode
- option :
- name : EDAM:
- value : Generic boolean
- type : normal
- qualifier : gcgmode
- default : false
- mandatory : false
- type : boolean
- prompt : Use GCG Unix mode for keyboard shortcuts and commands
- base :
- ordering : 5
- name : protein
- option :
- name : EDAM:
- value : Generic boolean
- type : normal
- name : calculated_default
- value : ${acdprotein}
- type : normal
- qualifier : protein
- default : false
- mandatory : false
- type : boolean
- prompt : Sequences are protein
- data :
- result :
- iotype : output
- base :
- standard :
- list :
- list_item :
- level : 0
- value : acedb
- level : 0
- value : asn1
- level : 0
- value : bam
- level : 0
- value : clustal
- level : 0
- value : codata
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- value : das
- level : 0
- value : dasdna
- level : 0
- value : embl
- level : 0
- value : experiment
- level : 0
- value : fasta
- level : 0
- value : fastq-illumina
- level : 0
- value : fastq-sanger
- level : 0
- value : fastq-solexa
- level : 0
- value : fitch
- level : 0
- value : gcg
- level : 0
- value : genbank
- level : 0
- value : genpept
- level : 0
- value : gff2
- level : 0
- value : gff3
- level : 0
- value : gifasta
- level : 0
- value : hennig86
- level : 0
- value : ig
- level : 0
- value : jackknifer
- level : 0
- value : jackknifernon
- level : 0
- value : mase
- level : 0
- value : mega
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- value : meganon
- level : 0
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- level : 0
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- value : ncbi
- level : 0
- value : nexus
- level : 0
- value : nexusnon
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- value : phylip
- level : 0
- value : phylipnon
- level : 0
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- level : 0
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- level : 0
- value : refseqp
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- value : strider
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- value : swiss
- level : 0
- value : text
- level : 0
- value : treecon
- type : full
- list_item :
- repeatable :
- list :
- base :
- data :
- option :
- name : emboss
- value : true
- type : normal
- name : installation
- value : Soaplab2 default installation
- type : normal
- name : version
- value : 6.3.0
- type : normal
- app_info :
- category : alignment_multiple
- help_url : http://emboss.sourceforge.net/apps/release/6.3/emboss/apps/mse.html
- event :
- action :
- id : _E_1
- parameter :
- analysis :
License(s): None Login to add license info Cost: No info yet Login to add cost info Usage Conditions: No info yet Login to add usage conditions info Contact Info: None Login to add contact info Publications: for this service. This can be a URI to the publication and/or a DOI. None Login to add publication info Citations: None Login to add a citation