This looks like a Soaplab service. Click here for more info and guidance on how to use this service )
About Soaplab
Soaplab services are command line applications, wrapped as SOAP services, and served from a Soaplab server. All Soaplab services have the same generic set of SOAP operations (depending on the Soaplab version) as they all share a standardised interface.
Certain tools, like the Taverna workflow workbench, provide automatic support for the Soaplab way of executing these services. In some cases you will need to use the Soaplab Server Base URL rather than the WSDL location in these tools.
More information on Soaplab clients is available here.
Further documentation on Soaplab services is available:
- Soaplab overview
- Soaplab client guide page
- EBI Soaplab server documentation
- Soaplab 2
- Sourceforge site for EMBOSS Soaplab services
Provider:
European Bioinformatics Institute (EMBL-EBI)
Location:
UNITED KINGDOM
Submitter/Source:
Mike Mayer (over 9 years ago)
Base URL:
http://www.ebi.ac.uk/soaplab/services/display.cirdna
WSDL Location:
http://www.ebi.ac.uk/soaplab/services/display.cirdna?wsdl(download last cached WSDL file)
Documentation URL(s): None Login to add a documentation URL Description(s): No description(s) yet Login to add a description ELIXIR Description(s): No info yet Login to add an elixir description Details (from Soaplab server): from Soaplab server(about 8 years ago)
- ds_lsr_analysis :
- analysis :
- name : cirdna
- output :
- installation : Soaplab2 default installation
- version : 6.3.0
- type : Display
- description : Draws circular maps of DNA constructs
- analysis_extension :
- input :
- analysis :
- ds_lsr_analysis :
- analysis :
- name : cirdna
- output :
- installation : Soaplab2 default installation
- version : 6.3.0
- type : Display
- description : Draws circular maps of DNA constructs
- analysis_extension :
- parameter :
- data :
- ioformat : unspecified
- iotype : input
- repeatable :
- base :
- base :
- name : ruler
- ordering : 8
- option :
- name : EDAM:0002135
- type : normal
- value : data Toggle
- default : false
- qualifier : ruler
- mandatory : false
- prompt : Draw a ruler
- type : boolean
- choice_list :
- grouptype : zero_or_more
- separator : ,
- base :
- name : blocktype_Open
- ordering : 10
- qualifier : Open
- default : false
- mandatory : false
- type : boolean
- prompt : Open blocks
- name : blocktype_Filled
- ordering : 11
- qualifier : Filled
- default : true
- mandatory : false
- type : boolean
- prompt : Filled blocks
- name : blocktype_Outline
- ordering : 12
- qualifier : Outline
- default : false
- mandatory : false
- type : boolean
- prompt : Black border
- base :
- choice_list :
- grouptype : zero_or_more
- separator : ,
- base :
- name : posticks_In
- ordering : 15
- qualifier : In
- default : false
- mandatory : false
- type : boolean
- name : posticks_Out
- ordering : 16
- qualifier : Out
- default : true
- mandatory : false
- type : boolean
- base :
- choice_list :
- grouptype : zero_or_more
- separator : ,
- base :
- name : posblocks_In
- ordering : 18
- qualifier : In
- default : true
- mandatory : false
- type : boolean
- name : posblocks_Out
- ordering : 19
- qualifier : Out
- default : false
- mandatory : false
- type : boolean
- base :
- standard :
- list :
- list_item :
- shown_as : Portable Network Graphics (png)
- level : 0
- value : png
- shown_as : Postscript
- level : 0
- value : colourps
- type : full
- list_item :
- repeatable :
- list :
- base :
- range :
- format : %d
- min : 1
- repeatable :
- base :
- name : maxgroups
- ordering : 4
- option :
- name : EDAM:0002152
- type : normal
- value : data Rendering parameter
- name : scalemin
- type : style
- value : 1
- default : 20
- qualifier : maxgroups
- mandatory : false
- prompt : Maximum number of groups
- type : long
- range :
- format : %d
- min : 1
- repeatable :
- base :
- name : maxlabels
- ordering : 5
- option :
- name : EDAM:0002152
- type : normal
- value : data Rendering parameter
- name : scalemin
- type : style
- value : 1
- default : 10000
- qualifier : maxlabels
- mandatory : false
- prompt : Maximum number of labels
- type : long
- range :
- format : %f
- max : 360
- min : 0
- repeatable :
- base :
- name : originangle
- ordering : 13
- option :
- name : EDAM:0002152
- type : normal
- value : data Rendering parameter
- name : scalemax
- type : style
- value : 360
- default : 90
- qualifier : originangle
- mandatory : false
- prompt : Position in degrees of the molecule’s origin on the circle
- type : float
- base :
- name : intersymbol
- ordering : 20
- option :
- name : EDAM:0002135
- type : normal
- value : data Toggle
- default : false
- qualifier : intersymbol
- mandatory : false
- prompt : Horizontal junctions between blocks
- type : boolean
- range :
- format : %d
- max : 15
- min : 0
- repeatable :
- base :
- name : intercolour
- ordering : 21
- option :
- name : EDAM:0002151
- type : normal
- value : data Colour
- name : scalemax
- type : style
- value : 15
- default : 1
- qualifier : intercolour
- mandatory : false
- prompt : Colour of junctions between blocks (enter a colour number)
- type : long
- base :
- name : interticks
- ordering : 22
- option :
- name : EDAM:0002135
- type : normal
- value : data Toggle
- default : false
- qualifier : interticks
- mandatory : false
- prompt : Horizontal junctions between ticks
- type : boolean
- range :
- format : %d
- min : 0
- repeatable :
- base :
- name : gapsize
- ordering : 23
- option :
- name : EDAM:0002152
- type : normal
- value : data Rendering parameter
- default : 500
- qualifier : gapsize
- mandatory : false
- prompt : Interval between ticks in the ruler
- type : long
- base :
- name : ticklines
- ordering : 24
- option :
- name : EDAM:0002135
- type : normal
- value : data Toggle
- default : false
- qualifier : ticklines
- mandatory : false
- prompt : Vertical lines at the ruler’s ticks
- type : boolean
- range :
- format : %f
- min : 0.0
- repeatable :
- base :
- name : textheight
- ordering : 25
- option :
- name : EDAM:0002152
- type : normal
- value : data Rendering parameter
- name : scalemin
- type : style
- value : 0.0
- help : Height of text. Enter a number <1.0 or >1.0 to decrease or increase the size, respectively
- default : 1.0
- qualifier : textheight
- mandatory : false
- prompt : Text scale factor
- type : float
- range :
- format : %f
- min : 0.0
- repeatable :
- base :
- name : textlength
- ordering : 26
- option :
- name : EDAM:0002152
- type : normal
- value : data Rendering parameter
- name : scalemin
- type : style
- value : 0.0
- help : Length of text. Enter a number <1.0 or >1.0 to decrease or increase the size, respectively
- default : 1.0
- qualifier : textlength
- mandatory : false
- prompt : Length of text multiplier
- type : float
- range :
- format : %f
- min : 0.0
- repeatable :
- base :
- name : tickheight
- ordering : 27
- option :
- name : EDAM:0002152
- type : normal
- value : data Rendering parameter
- name : scalemin
- type : style
- value : 0.0
- help : Height of ticks. Enter a number <1.0 or >1.0 to decrease or increase the size, respectively
- default : 1.0
- qualifier : tickheight
- mandatory : false
- prompt : Height of ticks multiplier
- type : float
- range :
- format : %f
- min : 0.0
- repeatable :
- base :
- name : blockheight
- ordering : 28
- option :
- name : EDAM:0002152
- type : normal
- value : data Rendering parameter
- name : scalemin
- type : style
- value : 0.0
- help : Height of blocks. Enter a number <1.0 or >1.0 to decrease or increase the size, respectively
- default : 1.0
- qualifier : blockheight
- mandatory : false
- prompt : Height of blocks multiplier
- type : float
- range :
- format : %f
- min : 0.0
- repeatable :
- base :
- name : rangeheight
- ordering : 29
- option :
- name : EDAM:0002152
- type : normal
- value : data Rendering parameter
- name : scalemin
- type : style
- value : 0.0
- help : Height of range ends. Enter a number <1.0 or >1.0 to decrease or increase the size, respectively
- default : 1.0
- qualifier : rangeheight
- mandatory : false
- prompt : Height of range ends multiplier
- type : float
- range :
- format : %f
- min : 0.0
- repeatable :
- base :
- name : gapgroup
- ordering : 30
- option :
- name : EDAM:0002152
- type : normal
- value : data Rendering parameter
- name : scalemin
- type : style
- value : 0.0
- help : Space between groups. Enter a number <1.0 or >1.0 to decrease or increase the size, respectively
- default : 1.0
- qualifier : gapgroup
- mandatory : false
- prompt : Space between groups multiplier
- type : float
- range :
- format : %f
- min : 0.0
- repeatable :
- base :
- name : postext
- ordering : 31
- option :
- name : EDAM:0002152
- type : normal
- value : data Rendering parameter
- name : scalemin
- type : style
- value : 0.0
- help : Space between text and ticks, blocks, and ranges. Enter a number <1.0 or >1.0 to decrease or increase the size, respectively
- default : 1.0
- qualifier : postext
- mandatory : false
- prompt : Space between text and ticks, blocks, and ranges multiplier
- type : float
- data :
- result :
- iotype : output
- base :
- data :
- result :
- iotype : output
- base :
- name : Graphics_in_PNG
- ordering : 32
- option :
- name : EDAM:0001278
- type : normal
- value : data Genetic map
- name : allow_non_existent
- type : normal
- value : true
- name : datatype
- type : normal
- value : bindata
- name : mimetype
- type : normal
- value : image/png
- name : nodisplay
- type : style
- value : true
- method : %%%Graphics_in_PNG%%% ${Graphics_in_PNG}
- qualifier : Graphics_in_PNG
- mandatory : false
- type : byte[][]
- data :
- option :
- name : EDAM:0000092
- type : normal
- value : topic Visualisation and rendering
- name : EDAM:0000096
- type : normal
- value : topic Nucleic acid sequence analysis
- name : EDAM:0000578
- type : normal
- value : operation DNA circular map drawing
- name : emboss
- type : normal
- value : true
- name : installation
- type : normal
- value : Soaplab2 default installation
- name : version
- type : normal
- value : 6.3.0
- app_info :
- category : display
- help_url : http://emboss.sourceforge.net/apps/release/6.3/emboss/apps/cirdna.html
- event :
- action :
- id : _E_1
- parameter :
- input :
- name : ruler
- default : false
- mandatory : false
- type : boolean
- name : blocktype_Open
- default : false
- mandatory : false
- type : boolean
- name : blocktype_Filled
- default : true
- mandatory : false
- type : boolean
- name : blocktype_Outline
- default : false
- mandatory : false
- type : boolean
- name : posticks_In
- default : false
- mandatory : false
- type : boolean
- name : posticks_Out
- default : true
- mandatory : false
- type : boolean
- name : posblocks_In
- default : true
- mandatory : false
- type : boolean
- name : posblocks_Out
- default : false
- mandatory : false
- type : boolean
- name : maxgroups
- default : 20
- mandatory : false
- type : long
- name : maxlabels
- default : 10000
- mandatory : false
- type : long
- name : originangle
- default : 90
- mandatory : false
- type : float
- name : intersymbol
- default : false
- mandatory : false
- type : boolean
- name : intercolour
- default : 1
- mandatory : false
- type : long
- name : interticks
- default : false
- mandatory : false
- type : boolean
- name : gapsize
- default : 500
- mandatory : false
- type : long
- name : ticklines
- default : false
- mandatory : false
- type : boolean
- name : textheight
- default : 1.0
- mandatory : false
- type : float
- name : textlength
- default : 1.0
- mandatory : false
- type : float
- name : tickheight
- default : 1.0
- mandatory : false
- type : float
- name : blockheight
- default : 1.0
- mandatory : false
- type : float
- name : rangeheight
- default : 1.0
- mandatory : false
- type : float
- name : gapgroup
- default : 1.0
- mandatory : false
- type : float
- name : postext
- default : 1.0
- mandatory : false
- type : float
- analysis :
License(s): No info yet Login to add license info Cost: No info yet Login to add cost info Usage conditions: No info yet Login to add usage conditions info Contact info: No info yet Login to add contact info How to cite this service: No info yet Login to add how to cite info Publications about this service: for this service (this can be in a common citation format like Bibtex, MLA or APA, a DOI, a URL, etc.) No info yet Login to add publications info Citations of this service: No info yet Login to add citations info Example workflows using this service: See all workflows on myExperiment that use this service Login to add workflows info