This looks like a Soaplab service. Click here for more info and guidance on how to use this service
About Soaplab
Soaplab services are command line applications, wrapped as SOAP services, and served from a Soaplab server. All Soaplab services have the same generic set of SOAP operations (depending on the Soaplab version) as they all share a standardised interface.
Certain tools, like the Taverna workflow workbench, provide automatic support for the Soaplab way of executing these services. In some cases you will need to use the Soaplab Server Base URL rather than the WSDL location in these tools.
More information on Soaplab clients is available here.
Further documentation on Soaplab services is available:
- Soaplab overview
- Soaplab client guide page
- EBI Soaplab server documentation
- Soaplab 2
- Sourceforge site for EMBOSS Soaplab services
Provider:
European Bioinformatics Institute (EBI)
Location:
United Kingdom
Submitter / Source:
uludag (about 1 year ago)
Base URL:
http://www.ebi.ac.uk:80/soaplab/typed/services/protein_2d_structure.topo
WSDL Location:
http://www.ebi.ac.uk/soaplab/typed/services/protein_2d_structure.topo?wsdl(download last cached WSDL file)
Soaplab Server Base URL:
http://www.ebi.ac.uk:80/soaplab/typed/services
Soaplab Server WSDL:
http://www.ebi.ac.uk/soaplab/typed/services/list?wsdl
Documentation URL(s): uludag (9 months ago)http://emboss.sourceforge.net/apps/release/6.0/emboss/apps/topo.html
Login to add a documentation URL Description(s): from provider’s description doc (6 months ago) Draws an image of a transmembrane protein
Franck Tanoh (about 1 year ago)This program predicts transmembrane segments in proteins, utilising the algorithm described in: “Persson, B. & Argos, P. (1994) Prediction of transmembrane segments in proteins utilising multiple sequence alignments J. Mol. Biol. 237, 182-192.”
tmap reads in one or more aligned protein sequences.
uludag (9 months ago)Draws an image of a transmembrane protein
Login to add a description Details (from Soaplab server): from Soaplab server(6 months ago)
- ds_lsr_analysis :
- analysis :
- name : topo
- type : PROTEIN 2D STRUCTURE
- installation : Soaplab2 default installation
- output :
- version : 6.1.0
- description : Draws an image of a transmembrane protein
- input :
- analysis_extension :
- analysis :
- ds_lsr_analysis :
- analysis :
- name : topo
- type : PROTEIN 2D STRUCTURE
- installation : Soaplab2 default installation
- output :
- version : 6.1.0
- description : Draws an image of a transmembrane protein
- input :
- name : membrane
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- mandatory : false
- type : boolean
- analysis_extension :
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- name : emboss
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- value : Soaplab2 default installation
- name : version
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- app_info :
- category : protein_2d_structure
- help_url : http://emboss.sourceforge.net/apps/release/6.1/emboss/apps/topo.html
- parameter :
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- list_item :
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- prompt : Are there any signature areas to be marked
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